在養殖水體中，我們常常可以看到水體中呈現赤潮現象，沸石能夠對這一問題有效解決。在實踐運用中，沸石粉和殺滅赤潮的藥物配合運用，能同時起到控制赤潮生物和改善水質的雙重作用。

隨著水產養殖業的開展，其規模不斷拓展的同時，帶來的污染問題愈發嚴重。飼料中少量的磷和氮不能被動物吸收而排出體外，形成污水中含有高濃度氮和磷，使水體富養分化。另外還需耗費大量的水來沖洗畜禽糞便，污水體積更是擴展了數倍甚至數十倍。未經處置的養殖廢水排放形成的環境惡化境況已經引起全球領域內外的關注。

沸石粉可以增加池水中無機物的含量，讓可溶性磷酸鹽的含量、總鐵含量有明顯的降低，趙玲等人通過研究沸石對赤潮生物的滅殺和控制造用，發現沸石起到緩釋銅離子及去除藻類作用，并有效防治了魚類因污染產生的病害。另外，向池中投加沸石粉，其可以將微生物、無機物和溶解氧吸附在表面，促進了生物體的新陳代謝，吸附了大量的無機污染物，有效提高了廢水的處理效率。

除此之外，沸石在養殖水體中還具有除氨氮添加氧氣的作用。飼料剩余、水產植物排泄物、水生植物尸體等都會導致氨氮富集問題發生，其對魚類養殖有著巨大的負面影響，抑制其健康成長。近年來的研究表明，魚類能臨時忍耐的最大限制氨濃度為0.025mg/L，應用沸石粉可以吸附氨、二氧化碳、硫化氫等少量有毒物質，在育苗和養殖階段向漁場傾瀉沸石粉，就可以除去養殖水體中的氨氮，保證水質清新。